La sesión de entrenamientos clasificatorios de Moto3 para el Gran Premio Monster Energy de la República Checa arrancaba en el histórico Autódromo de Brno con una Q1 comandada por el piloto del Ángel Nieto Team Raúl Fernández, seguido por Yurchenko, López y Oncu, un cuarteto que se sumaría a la lista de los 18 pilotos más rápidos para disputar los 15 minutos de la Q2 y luchar por la pole. Arenas lo intentaba hasta el final pero terminaba quinto a 0.7 de Fernández. La meteorología no era la ideal, con lluvia débil, cielo encapotado y baja temperatura, nada parecido a un agosto ideal.
La segunda tanda clasificatoria comenzaba con la tabla de tiempos encabezada por Arbolino, seguido de Salac, Fernández, López y McPhee. La lluvia comenzaba a arreciar en el momento que Arbolino marcaba un 2’19.9 para escalar al primer puesto, seguido por McPhee, Fernández, Masiá, Ogura, Suzuki, Antonelli, Yurchenko, Canet y Fenati.
Los últimos 5 minutos serían decisivos, con varios pilotos forzando el ritmo. McPhee, Arbolino y Suzuki mandaban, con Fernández, López y Masiá por detrás. Arbolino (2’18.0) recuperaba el primero poco después, con Fernández y Canet a menos de un segundo. Con el tiempo cumplido, la primera posición de Arbolino no cambiaría, un gran especialista en agua, con McPhee y Antonelli cerrando la primera fila de la parrilla, desplazando a Suzuki, Fernández (que se iba al suelo en la última vuelta) y Canet a la segunda.